وضع صندوق مصر السيادي القطاع الزراعي والتصنيع الغذائي كأولوية قصوى وركيزة من ركائز الحياة في الدولة بهدف:

الحفاظ على أمن الغذاء بما يتماشى مع مستهدفات رؤية مصر ٢٠٣٠ والبرنامج الوطني للإصلاحات الهيكلية

جذب استثمارات القطاع الخاص لزيادة إنتاجية القطاع الزراعي باستخدام أحدث الوسائل التكنولوجية في القطاع

الاستفادة من أراضي مصر الخصبة وتنوع محاصيلها الزراعية عالية الجودة لتعظيم القيمة المضافة للقطاع وصادراته

الاستثمارات تحت مظلة هذا القطاع تدار حاليا بشكل مباشر من الصندوق الرئيسي.